เชื้อราเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีบทบาทสำคัญในฐานะผู้ย่อยสลายของระบบนิเวศ มีการดำรงชีวิตได้หลากหลาย ทั้งอยู่เป็นอิสระ ดำรงชีวิตแบบปรสิต และราเอนโดไฟต์ เชื้อราส่วนใหญ่จะมีการดำรงชีวิตแบบการย่อยสลาย และดูดซึมสารอาหารจากซากของสิ่งมีชีวิตที่ตายแล้ว จากการดำรงชีวิตที่หลากหลายของเชื้อรา ทำให้มีการนำ เชื้อราไปใช้ประโยชน์ได้มากมาย ทั้งทางด้านอุตสาหกรรม เกษตรกรรม การแพทย์ และสิ่งแวดล้อม ทั้งนี้ ทางด้าน การฟื้นฟูสิ่งแวดล้อมทางชีวภาพ พบว่า เชื้อราสามารถกำจัดสารพิษออกจากสิ่งแวดล้อมได้หลายชนิดทั้ง สารประกอบโพลีไซคลิก อะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน สารกำจัดศัตรูพืชกลุ่มออร์กาโนคลอรีน สีย้อม และโลหะหนัก กลไกที่เชื้อราใช้ในการบำบัดมีทั้งการดูดซับไว้กับโครงสร้างของผนังเซลล์และการย่อยสลายด้วยเอนไซม์ที่หลั่ง ออกมานอกเซลล์